Для этого от каждой из выдающихся по фенотипу пчелиных семей выводят, как минимум, по 25 маток-дочерей и обеспечивают их спаривание с трутнями, происходящими из одних и тех же отцовских семей (на изолированном случном пункте или с помощью инструментального осеменения). Молодых плодных маток подсаживают в пчелиные семьи или отводки, входящие в состав групп, сформированных на основе принципа аналогов. Маток-дочерей от одной проверяемой рекордистки подсаживают в семьи и отводки первой группы, от следующей — второй группы и т.д. Все дочерние семьи пропорциона1ьно распределяются по пасекам-испьггательницам. Пасеки-испытательницы должны находиться в наиболее типичных для данной зоны условиях медосбора и повозможности ближе друг к другу. Условия содержания пчелиных семей всех дочерних групп и уход за ними должны быть одинаковыми в течение всего периода их сравнительной оценки.
Во время осенней ревизии оценивают состояние всех дочерних семей, а вначале следующего сезона проводят их главную весеннюю ревизию. Сопоставляя данные обеих ревизий, определяют зимостойкость пчелиных семей всех групп. В течение сезона ведут наблюдения за признаками дочерних семей, и прежде всего за их продуктивными качествами, а в конце сезона — бонитируют их. Затем рассчитывают средние показатели этих признаков по каждой группе дочерних семей в целом по всем пасекам-испытательницам. После, сопоставляя данные, характеризующие признаки каждой группы дочерних семей, устанавливают, какая из проверявшихся по качеству потомства семейрекордисток наиболее устойчиво передала дочерним семьям свои выдающиеся качества, и прежде всего высокую продуктивность. Высокопродуктивные семьи пчел, оказавшиеся наиболее ценными в племенном отношении, т.е. наиболее полно передавшие дочерним семьям свои качества, называются семьями-улучшательницами.
Следующий сезон семьи-улучшательницы интенсивно используют для массовой репродукции молодых маток и продолжения селекционной работы с ними. Если к этому времени проверявшаяся по качеству потомства матка погибает, то для массовой репродукции используют одну из лучших ее дочерей. Отбор по боковым родственникам, или отбор по сибсам и иолусибсам, применительно к медоносной пчеле заключается в том, что для размножения отбирают не любую выдающуюся по фенотипу пчелиную семью, а ту из них, которая имеет наибольшее число семей сестер или полусестер, превосходящих по продуктивным качествам среднепасечные показатели.
Отбор по сибсам и полусибсам имеет то преимущество, что открывает возможность генотипического отбора пчелиных семей, выделившихся по фенотипу на том этапе, когда их маткам исполнилось немногим более одного года, а также возможность их использования для интенсивной репродукции в начале следующего сезона, когда они еще не достигнут двухлетнего возраста.
Если уже освоен отбор по генотипу, в том числе и отбор по качеству потомства, то не так уж трудно перейти к более совершенной форме селекционной работы — к выведению заводских линий.
Заводская линия — это группа высокопродуктивных пчелиных семей, происходящих по материнской стороне родословной не от какой-либо, а от выдающейся матки-родоначальницы (или от нескольких выдающихся родоначальниц), признаки которой (которых) поддерживаются в них с помощью целенаправленного отбора, племенного подбора, а также умеренного инбридинга и устойчиво наследуются. Пчелиные семьи конкретной линии обладают определенными качественными особенностями, отличающими их от других линий этой же породы. Каждая линия должна подразделяться, как минимум, на 2—3 ветви, несколько отличающиеся друг от друга по своим родословным (в рамках общей для линии генеалогии). Обычно заводская линия существует на протяжении 5—7 поколений, но иногда прибегают к разведению коротких линий (в 3—5 поколений) с тем, чтобы уменьшить опасность инбридинг-депрессии.
Приступая к работе, сразу начинают формировать 2—3 линии. Это объясняется тем, что пчелиные семьи, полученные от межлинейного скрещивания (кроссы), превосходят «линейные» семьи в жизнеспособности и продуктивности. Поэтому для получения высокопродуктивных пользовательных семей чистопородных пчел необходимо иметь, как минимум, 2 заводские линии.